Caracterización molecular y proteómica de hongos rizosféricos de tres especies arbóreas plantadas en la zona perturbada de Secoya 26 y zona no perturbada de Secoya 2-3, por la actividad de extracción de petróleo en la Amazonía ecuatoriana

Abstract

La contaminación de suelos por la actividad petrolera es una problemática a nivel mundial por que afecta la diversidad fúngica, degrada los suelos y contamina el agua. Con la finalidad de minimizar este impacto, se activaron las especies fúngicas que están presentes en las tres especies arbóreas Piptadenia pteroclada, Platymiscium pinnatum y Zygia longifolia, en la zona de lodos y ripios de Secoya 26 y la zona de potreros de Secoya 2-3 y su potencial en la biorremediación de suelos. De los cuales se seleccionaron 14 hongos para caracterización molecular por secuenciación SANGER y caracterización proteómica con el equipo MALDI-TOF MS, dichos hongos fueron caracterizados morfológicamente utilizando claves dicotómicas identificados previamente, de estos seis corresponden a la zona de Secoya 2-3 y ocho pertenecen a Secoya 26. Se obtuvo el ADN de cada cepa mediante un protocolo estandarizado de extracción y, mediante técnicas PCR y el uso de los primers ITS1 e ITS4, se obtuvieron los amplicones que fueron secuenciados. Las cepas fueron identificadas como Aspergillus fumigatus, Geotrichum candidum, Mucor irregularis, Mucor sp., Penicillium citrinum, Rhizopus arrhizus, Trichoderma sp. y Trichoderma virens, estos resultados fueron comparados con los obtenidos por MALDI-TOF evidenciando que la caracterización proteómica carece de una base de datos amplia para identificar los hongos seleccionados. La zona contaminada se encontró mayor diversidad de especies y una mayor riqueza específica.