Caracterización morfológica y molecular de hongos filamentosos asociados a los suelos del sector de Avicultura de la Hacienda “El Prado” - IASA I, para el establecimiento de una línea base con fines de biorrestauración

Abstract

Los hongos filamentosos desempeñan un papel esencial en el funcionamiento de los ecosistemas del planeta, de los que se desataca su rol como patógenos, descomponedores o mutualistas. Sin embargo, el equilibrio ecológico se ha visto afectado por actividades como el monocultivo, compactación de suelos y uso extendido de fertilizantes químicos. En el presente estudio se desarrolló la caracterización morfológica e identificación molecular de hongos filamentosos presentes en el suelo del sector de avicultura de la Hacienda “El Prado” IASA – I. El aislamiento de las cepas se realizó mediante la captura con trampas microbianas con arroz como sustrato. Se purificaron las cepas empleando medio de cultivo PDA y se identificaron mediante claves taxonómicas de acuerdo con sus estructuras microscópicas. La identificación molecular empleó extracción convencional de ADN genómico con CTAB, amplificación de la región ITS por PCR convencional y secuenciación Sanger. Se obtuvieron 51 aislamientos puros agrupados en 24 morfoespecies, de las cuales 20 se identificó a nivel de especie y 4 a nivel de género, distribuidos en 9 géneros y 7 órdenes. Los géneros con más especies identificadas fueron Fusarium, Mucor y Trichoderma. La evaluación de la biodiversidad del suelo mostró que el sector de avicultura presenta una alta biodiversidad (Dmg= 5.85, H’ = 3.03), y homogeneidad de abundancia entre especies de hongos filamentosos (D = 0.055, D’ = 0.945 y J’ = 0.954). El estimador no paramétrico de riqueza Chao 1 (29 especies) y la proporción de singletons y doubletons (70.8%), indican que la técnica de recolección tiene limitaciones para la captura de especies poco frecuentes. Se estableció el cepario morfo-molecular a partir de aislados crioconservados discos de agar colonizados con solución protectante de glicerol (10%) y peptona (0.1%). Se clasificaron los aislamientos puros en antagonistas (41.18%), fitopatógenos (35.29%), patógenos oportunistas de animales (3.92%) y saprófitos (19.61%).