Estandarización de un protocolo para la extracción de ADN de muestras fecales de lobo de páramo (Lycalopex culpaeus)

Abstract

Lycalopex culpaeus, conocido en el Ecuador como lobo de páramo o zorro andino es un cánido endémico que habita en los Andes de Sudamérica. La falta de estudios sobre su ecología y el alto riesgo de extinción de la especie en el Ecuador, han hecho de vital importancia establecer nuevos métodos que permitan recopilar información de la especie. En este contexto, esta investigación se propuso estandarizar un protocolo de extracción de material genético (ADN) a partir de muestras fecales de lobo de páramo. Este tipo de protocolo permite obtener información ecológica y genética valiosa de la especie, sin la necesidad del contacto directo con el animal. De igual manera, disminuye los costos del muestreo ya que no es necesaria la captura de los lobos. En este estudio se evaluaron tres métodos manuales para la extracción de ADN a partir de muestras fecales recolectadas en el Parque Nacional Cayambe-Coca: el método SDS/CAI utilizado para extraer ADN de heces humanas, CTAB/CAI aplicado en heces de monos aulladores del Brasil (Alouatta caray) y 2CTAB/CAI empleado en heces de primates del mediterráneo (Macaca sylvanus) y gorilas (Gorilla g. gorilla). Los resultados visualizados en geles de agarosa al 0.8% muestran una extracción positiva para los tres métodos. La cuantificación del ADN y la evaluación de su pureza mediante la medición de su absorbancia a 260/280 nm demostraron que el mejor método es 2CTAB/CAI con valores promedio de 51.16 ng/ l de ADN y pureza de 1.65