Caracterización molecular de Polymyxa graminis L. en suelos dedicados al cultivo de arroz y raíces de Oryza sativa L. en invernadero

Abstract

En los últimos años, los cultivos de arroz en el Ecuador, principalmente en la región Costa, se han visto afectados por la enfermedad viral Rice stripe necrosis virus (RSNV) que ha provocado daños parciales y, en ciertos casos, totales de los sembríos, causando pérdidas económicas a los agricultores. Dicha enfermedad es transmitida mediante el plasmodiofórido Polymyxa gramnis L., un patógeno obligado, que al infectar las raíces de Oryza sativa L., induce varios síntomas, siendo el más común la necrosis (amarillamiento) de las raíces, tallos y limbo de la planta. Además, produce un entorchamiento en las hojas, evidente para identificar la enfermedad, provocando la muerte de la planta. El presente estudio caracterizó molecularmente al vector P. gramnis a partir de muestras de raíces de plantas enfermas y suelo. Se usaron para la amplificación de los fragmentos mediante PCR dos pares de cebadores específicos del vector Psp1-Psp2rev y ITS5-Pxrev7 para finalmente realizar el análisis filogenético de las secuencias obtenidas. Las secuencias corresponden al ribotipo V forma especial colombiana con una distancia de 0.02 entre Meta y Afr2; secuencias aisladas de arroz que presentan un porcentaje del 98% de identidad.