Resumen:
El arroz (Oryza sativa L.) se caracteriza por ser un alimento fundamental para la dieta de varias regiones en todo el mundo. Desde el aparecimiento de la enfermedad del entorchamiento en el año de 1977, al oeste de África en Costa de Marfil, ha provocado pérdidas de rendimiento de hasta el 40% de los cultivos de arroz. (Lozano & Morales, 2009) La enfermedad se caracteriza por provocar en las plantas de arroz: deformaciones en la hoja a manera de zigzag, necrosis en los tallos y a lo largo del limbo, aparecimiento de bandas cloróticas en el limbo y pérdida de masa en el sistema radicular; síntomas que pueden resultar hasta en la muerte de la planta. Esta enfermedad es causada por el virus Rice stripe necrosis virus (RSNV), el cual es transmitido por un endoparásito obligado Polymyxa graminis L. Molecularmente, el virus ha sido reportado en países africanos como Sierra Leona, Mali y Burkina Faso; en Sudamérica se ha confirmado la presencia de la enfermedad, siendo únicamente Colombia, Argentina y Brasil los países que han presentado aislados del virus. El presente estudio se encargó de realizar una caracterización molecular del virus que provoca la enfermedad del entorchamiento. Se utilizó para la amplificación de la región de dominio helicasa del RNA1 del virus los primers RSNV1-2901F y RSNV1-3827R, para posteriormente realizar el análisis filogenético correspondiente. La secuencia aislada tiene un porcentaje de identidad de 99,66% con la secuencia reportada en Colombia (EU099844). El árbol filogenético tiene estructura geográfica, la secuencia de Ecuador forma un clado junto con la de Colombia, este clado es divergente del formado por las secuencias de varios países en África, y las secuencias de Argentina y Brasil.
