Caracterización molecular y proteómica de hongos rizosféricos de tres especies arbóreas leguminosas plantadas en el centro de gestión de pasivos Auca 02 y en la plataforma que circunscribe el pozo petrolero Sansahuari 02 Amazonía del Ecuador

Abstract

Con el creciente impacto de la explotación petrolera en la región Amazónica, la comprensión del cómo los microorganismos del suelo pueden influir en la adaptación de las plantas a las condiciones cambiantes del entorno, se ha vuelto crucial. Por ello el presente trabajo se estudió la identidad específica y la biodiversidad de hongos rizosféricos presentes en tres especies arbóreas leguminosas, plantadas dos áreas de interés ecológico en la Amazonía ecuatoriana: el Centro de Gestión de Pasivos Auca 02 y la plataforma que circunscribe al pozo petrolero Sansahuari 02. Se recuperaron cepas aisladas de estudios anteriores, del total de aislamientos activados se seleccionaron 10 para el análisis avanzado de secuenciación genómica y proteómica. La caracterización proteómica MALDI-TOF permitió identificar a Aspergillus niger y Aspergillus terreux que presentaron un 76 y 77.90 % de similitud, respectivamente. Dentro del proceso de caracterización molecular se estableció un protocolo para realizar la extracción del ADN genómico con el que se logró la extracción del 90% de las 10 cepas seleccionadas. Posteriormente, se amplificó la región ITS ITS1 (TCCGTAGGTGAACCTGCGG) e ITS4 (TCCTCCGCTTATTGATATGC) cuyos amplicones se enviaron a secuenciar a Macrogen por el método Sanger. Las secuencias crudas del ADN obtenidas fueron ensambladas y curadas, las cuales se compararon con las depositadas en el GenBank utilizando la herramienta BLAST de la National Center for Biotechnology Information (NCBI). Se obtuvo valores entre 99,29 y 100 % de similitud mismos que corroboraron la identidad de las cepas. Los análisis ecológico-matemáticos mostraron que la diversidad está estrechamente ligada a la especie arbórea y no al nivel de contaminación.