Identificación de genes expresados diferencialmente en ratones con fibrosis pulmonar expuestas a dos terapias de reposición mitocondrial utilizando herramientas bioinformáticas

Abstract

Los estudios bioinformáticos, enfocados en el análisis diferencial de genes en modelos de ratones Mus musculus con fibrosis pulmonar, ofrecen una vía innovadora para comprender los mecanismos moleculares, identificar patrones de expresión génica y evaluar tratamientos, con el potencial de impulsar avances significativos en el manejo clínico y el desarrollo terapéutico de la enfermedad. El control de calidad y evaluación de duplicados garantiza la integridad de los datos de RNA-seq, respaldando la alta calidad de las muestras y el éxito del proceso de alineación. El análisis de expresión diferencial utilizando muestras de control y dos tratamientos: el primero con células mesenquimales humanas (hMSC) con nanopartículas de óxido de hierro (Fe-hMSC) y el segundo con con células mesenquimales humanas (hMSC) con nanopartículas de óxido de hierro infusionadas con pioglitazona (PgFe-hMSC), los cuales revelan más de 12,000 genes diferencialmente expresados de alta calidad. El análisis de expresión génica con DESeq2 revela relaciones diferenciales entre tratamientos, destacando la efectividad potencial del tratamiento 2 con PgFe-hMSC. Además, el enriquecimiento funcional, especialmente con respecto a la función molecular dentro de la ontología génica, y la significancia en la vía de transducción olfatoria sugieren mecanismos relevantes en la fibrosis pulmonar, respaldando la utilidad de las herramientas bioinformáticas para comprender la patología y la respuesta a tratamientos específicos.