Resumen:
Actualmente los bosques de Polylepis están disminuyendo debido a diversas actividades antropogénicas. En los últimos años se han hecho ciertos esfuerzos para conservarlos y regenerarlos, sin embargo, las reforestaciones no han sido realizadas de una manera técnica ya que no se ha tomado en cuenta el estado del acervo genético de las poblaciones. El conocimiento de la estructura genética de las poblaciones con las interrelaciones de las características del lugar, parámetros históricos y diferenciación genética proveen invaluable información para la formulación de políticas de protección y administración, efectivas para especies en peligro. Por ello, en este estudio se buscó conocer la estructura genética poblacional de Polylepis incana y P. pauta en los páramos de Papallacta y Los Ilinizas mediante ISSRs. Para lo cual, se recolectaron muestras de tres poblaciones en los páramos de Papallacta y los Ilinizas, se aisló ADN y se amplificó secuencias ISSR con un set de 10 primers. Del análisis de los datos registrados se observó que la menor diversidad genética la presentó P. incana y la población con mayor diversidad genética fue la de P. pauta de Papallacta. Todos los individuos se agruparon en la población a la que pertenecían y la tendencia de agrupamiento se dio en función de la especie más no de la localidad muestreada, debido a que no se presentó correlación entre la similaridad genética y la localización geográfica. La varianza molecular dentro de las poblaciones es muy baja, mientras que entre poblaciones es alta, lo cual indica un proceso de fragmentación y deriva génica, debido a los indicios de divergencia genética entre las poblaciones y la disminución de la disimilaridad de los individuos, además sugiere que en las poblaciones analizadas no se está generando una respuesta adaptativa al medio
