Resumen:
La provincia de Loja lidera el ranking nacional de rendimiento con un valor promedio de 8.96 t/ha por lo que es de importancia identificar las variedades cultivadas en este sector. Este estudio tiene como objetivo la caracterización molecular de variedades de arroz cultivadas en los cantones de Zapotillo y Macará de la provincia de Loja, utilizando marcadores microsatélites (SSRs) para lo cual se utilizó 20 variedades provenientes del programa de arroz de INIAP como referenciales y 61 materiales recolectados en la zona de estudio. Se estableció un panel de 17 marcadores con un total de 75 alelos y un promedio de 4 alelos/locus que permiten identificar las variedades de arroz provenientes del programa de arroz y de campo. Se realizó un análisis de diversidad genética en el que se encontró que existe variabilidad entre las variedades estudiadas pese a la naturaleza endogámica del arroz de acuerdo a los valores PIC promedio, el análisis molecular de varianza y los valores obtenidos de los estadísticos F de Wright FIS, FIT y FST; el análisis de estructura genética dividió a los individuos en estudio en dos poblaciones, se obtuvieron 127 genotipos multilocus de los 226 totales. Por último, se identificaron genotipos duplicados en donde el 18.90% corresponden a la variedad FED-60 y es probable que el 0.79% correspondan a la variedad SFL-09 debido a que comparten 26 de los 34 alelos analizados, se encontraron también 8 agrupaciones y no se logró identificar 53 de los 127 genotipos multilocus.
