Abstract:
Con el creciente impacto de la explotación petrolera en la región Amazónica, la comprensión del cómo los microorganismos del suelo pueden influir en la adaptación de las plantas a las condiciones cambiantes del entorno, se ha vuelto crucial. Por ello el presente trabajo se estudió la identidad específica y la biodiversidad de hongos rizosféricos presentes en tres especies arbóreas leguminosas, plantadas dos áreas de interés ecológico en la Amazonía ecuatoriana: el Centro de Gestión de Pasivos Auca 02 y la plataforma que circunscribe al pozo petrolero Sansahuari 02. Se recuperaron cepas aisladas de estudios anteriores, del total de aislamientos activados se seleccionaron 10 para el análisis avanzado de secuenciación genómica y proteómica. La caracterización proteómica MALDI-TOF permitió identificar a Aspergillus niger y Aspergillus terreux que presentaron un 76 y 77.90 % de similitud, respectivamente. Dentro del proceso de caracterización molecular se estableció un protocolo para realizar la extracción del ADN genómico con el que se logró la extracción del 90% de las 10 cepas seleccionadas. Posteriormente, se amplificó la región ITS ITS1 (TCCGTAGGTGAACCTGCGG) e ITS4 (TCCTCCGCTTATTGATATGC) cuyos amplicones se enviaron a secuenciar a Macrogen por el método Sanger. Las secuencias crudas del ADN obtenidas fueron ensambladas y curadas, las cuales se compararon con las depositadas en el GenBank utilizando la herramienta BLAST de la National Center for Biotechnology Information (NCBI). Se obtuvo valores entre 99,29 y 100 % de similitud mismos que corroboraron la identidad de las cepas. Los análisis ecológico-matemáticos mostraron que la diversidad está estrechamente ligada a la especie arbórea y no al nivel de contaminación.
